生物有机肥设备通气在堆肥过程中 ，通风方式主要包括翻堆、强制通风和抽气三种。而通风的作用主要有三个 :供氧、散热和降低含水率。

生物有机肥设备不同通风方式和通风量大小直接影响堆肥高温好氧微生物生长活动,并最终影响堆体温度的升高、病原菌的杀灭以及有机质的分解。机械翻堆的堆肥在堆制过程中达到的最高温度为67C ,而强制通风方式仅为60C，说明强制通风方式在保证实现堆肥的“无害化”前提下,具有更好的散热能力 :前者的水分去除率是 15%，而后者是11%(初始含水率均为60%)，两种通风方式都能有效的杀灭有害微生物。

生物有机肥发酵设备不同通风方式对猪粪高温堆肥氮素和碳素变化的影响，强制通风与机械翻堆相结合的方式是最佳的通风方式，它可以加快堆肥温度升高，促进NH: -N(铵态氮)向NO; -N(硝态氮)转化，有利于水溶性碳(DOC)分解和固相 C/N降低 ,从而加快堆肥的腐熟。